Καταρχάς, πρέπει να πούμε ότι η Apple δεν έκανε τους ενσωματωμένους browsers να τρέχουν πιο αργά, απλώς ο Safari τρέχει πιο γρήγορα. Οι εφαρμογές που χρησιμοποιούν ενσωματωμένους browsers ή τα web apps που εκκινούνται από το homescreen σε fullscreen κάνουν χρήση της παλιάς Javascript μηχανής και όχι της Nitro. Γενικότερα, βέβαια, υπήρξαν πολλές βελτιώσεις στον νέο Safari και η νέα μηχανή Nitro είναι αποκλειστικό «προνόμιο» του Mobile Safari. Οπότε, γιατί συμβαίνει αυτή η διάκριση; Οι κακεντρεχείς έσπευσαν να δηλώσουν αμέσως ότι η κίνηση αυτή είναι επιτηδευμένη για να αποθαρρύνει την χρήση των web apps και να προωθήσει τις αντίστοιχες App Store εφαρμογές. Κάτι τέτοιο προφανώς και είναι λανθασμένο για τον απλό λόγο ότι ούτε οι App Store εφαρμογές με ενσωματωμένο browser κάνουν χρήση της μηχανής Nitro.

Ο πραγματικός λόγος αφορά την ασφάλεια. Ο μεγαλύτερος λόγος που η μηχανή Nitro αποδίδει καλύτερα από την προηγούμενη είναι η χρησιμοποίηση του JIT (just-in-time) compilation, που απαιτεί τη δυνατότητα μαρκαρίσματος των σελίδων μνήμης στη RAM ως εκτελέσιμες αλλά, όμως, κάτι τέτοιο στο iOS δεν επιτρέπεται για σοβαρούς λόγους ασφαλείας. Οι περισσότεροι μοντέρνοι browsers επιτρέπουν αυτή τη δυνατότητα προς όφελος της απόδοσης συμπεριλαμβανομένων και των Mac OS X, Windows κτλπ. Ωστόσο, στο iOS 4.3 γίνεται μια εξαίρεση, η οποία εφαρμόζεται αποκλειστικά στον Mobile Safari.
Πρόκειται ουσιαστικά για έναν συμβιβασμό όσον αφορά την ασφάλεια και η Apple επέλεξε στο iOS 4.3 να «εμπιστευτεί» τον Mobile Safari. Αυτό έχει ως θετική συνέπεια την σημαντική αύξηση της ταχύτητας αλλά σε περίπτωση που βρεθεί κάποιο κενό ασφαλείας θεωρητικά θα επιτρέπεται μεγαλύτερος έλεγχος στο σύστημα απ' ότι πριν.
Βέβαια, δεν είναι ότι η μηχανή Nitro δεν μπορεί να γίνει διαθέσιμη και σε web apps ή εφαρμογές με ενσωματωμένους browsers. Απλώς η Apple δεν έχει τελειώσει (

Μάλιστα, κάτι τέτοιο βρίσκεται ήδη σε ανάπτυξη από την Apple από το WebKit2 project όπου το JavaScript, HTML κτλπ τρέχουν σε διαφορετική διαδικασία από την ίδια την εφαρμογή (κάτι τέτοιο χρησιμοποιεί ήδη ο Google Chrome αλλά δεν είναι ενσωματωμένο στο framework). Αυτό κάποια στιγμή θα γίνει διαθέσιμο και για το iOS και θα λύσει πολλά από τα υφιστάμενα προβλήματα.